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近年来, 一种引起石斑鱼苗种培育阶段的肠道微孢子虫病在海南广泛传播, 损失严重, 其主要症状为厌食、肠壁变薄、鱼体极度消瘦、排白便等症状, 造成苗种的大量死亡, 死亡率最高可达100%,危害仅次于石斑鱼神经坏死病毒病。由于其最直观的临床症状为患病鱼极度消瘦, 故当地渔民也称其为“瘦shen病", 该病病原为肠胞虫科, 肠孢虫属(Enterospora)一新种, 命名为石斑鱼肠孢虫(Enterospora epinepheli sp. n.)。

微孢子虫是一类泛在的、成孢子的、单细胞专性细胞内寄生虫, 宿主范围广泛, 可寄生于从原生动物到哺乳动物(包括人类)几乎所有动物类群。鱼类是微孢子虫的主要宿主之一, 目前已报道21属160余种, 绝大部种类感染硬骨鱼类。

已报道3种石斑鱼微孢子虫病, 病原分别为寄生于清水石斑鱼(Epinephelus polyphekadion)肠壁的阿拉伯格留虫(Glugea arabica)、寄生于网纹石斑鱼(E. chlorostigma)腹腔的匹里虫待定种、寄生于赤点石斑鱼(E. akaara)腹腔的石斑鱼格留虫(G. epinephelusis)。

全年都可检测到，暴发通常发生在 5 月至 11 月的雨季，水温在 26 至 30℃ ，盐度28-34 ppt。